如果是Spine导出配置错误，可能会引起楼主的问题。
首先，在导出设置里，不支持勾选预乘。这里要重点注意。
其次，当前的版本只支持点过滤（Nearest）模式，不支持线过滤（Linear）模式。当然这个问题已经解决，在此时还没发版，Linear功能在3.0.3版本开始得以支持。
点过滤的正确导出配置与IDE中的使用流程如下，
一、导出目录配置
要注意数据为二进制，扩展名为.skel，并勾选纹理图集打包。然后点开打包设置进行检查，配置是否正确。如下图所示：
二、关键配置，过滤缩小与放大为Nearest（点过滤）、预乘（不要勾选），保存，如下图所示：
三、LayaAir3-IDE里的配置，对spine的图集纹理设置为精灵纹理即可。如下图所示：
如果还有问题的，先看一下默认值里的各向异性是不是1，如果不是的，改为1，点应用。（这个步骤算是一个BUG，精灵纹理里不应该受各向异性的影响。在LayaAir3.0.3也会修复的，先临时这样解决，3.0.3开始不需要这个流程）
各向异性的设置没问题之后，再切回精灵纹理类型，再点应用。应该就好了。
最后，运行后查看效果。以最终运行效果为准（此时是基于Spine运行的），
这里需要注意的是，IDE里编辑预览时，如果spine是点过滤，那纹理那里也要对应的点过滤，也就是spine的纹理设置要与IDE中的设置要统一，否则预览效果可能会与实际运行效果有差异。
