[]typescript开发项目，js文件引用顺序问题

ts版本下js加载顺序不正确，有什么办法解决，目前是要移植一个项目，代码有两三千个文件，手动维护不太可能。我在论坛搜索“script顺序”就能找到十条反馈这个问题。这个问题只在ts版本下存在？

这个问题不解决，基本没办法用ts开发啊
as3版本和js版本都没有这个问题吗？