[LayaAir 1.0]请问TS项目下代码js的版本应该如何管理？

1.0的TS项目底下，TS代码文件翻译成js后，会作为script标签，自动被添加到index.html里面。
 
请问对于发布到外网的版本，如何对这些TS代码添加版本管理以达到热更的目的？
 
如果手动在src路径后面加上版本号，比如：
<script src="js/scene.js?v=1.01"></script>
再次编译之后，index.html会重新生成，会把修改的版本号覆盖掉。
 
还有，觉得手动编辑版本号也不是一个理想的方案，因为一个项目里的js文件可能很多，两个版本之间有修改的js文件数也有可能会很多。如果手动选出来编辑，太笨拙且消耗工作量。
 
请问合理的解决方案是什么呢？非常感谢。